基本的世界设定、主要人设和主角穿越产生影响之前的剧情主线肯定不变，但毕竟跟漫画不同，不可能完全忽视逻辑。为了避免逻辑BUG，原著中的剧情和设定在本书中会有一定的改动，主要有这么几点：
包括各国人口在内的一切会导致世界设定无法自洽的不合理数据都进行了合理化调整，比如鱼人岛人口由500万砍到了5万，佐乌也减到了3000多，这样空间上才住得下，同时也符合鱼人跟毛皮族个体强但族群弱的基本定位；
而海军伟大航路支部的常驻兵力则大幅增加到5000以上，如果直接按SBS里作者的说法，拥有至少数艘主力军舰的一个支部的常驻兵力才300人，还不及半艘主力军舰的载员人数，这也太离谱了。
主线剧情的结果不变，但具体的经过可能有变动，举个例子，路飞在阿拉巴斯坦打败了克洛克达尔、阻止了他的阴谋是不变的，事后哪些人跑了哪些人被抓也不会变，但是路飞具体是怎么打败克洛克达尔的，就未必会遵循原著的设定了。
PS：尤其和之国剧情实在是崩得太厉害，甚至就连引出的设定也只能部分采用。
绝大部分只出现在剧场版的人物（泽法也不例外）和剧情都不存在。
PS：在漫画里侧面提及的金狮子也改成在暴风雨中落水而死，没办法，这个家伙的剧情从头到尾都是BUG，而且这些BUG带到主线剧情之后还会引发更多的BUG，实在是圆不过来......
动画原创的内容和官方生命卡中的人物信息仅供参考，酌情选用。